基于双向电泳技术的体液蛋白质组学研究进展
中国药理学与毒理学杂志2003年8月;17(4)构及功能鉴定,获得相应的生物标志物和(或)药物作用靶点,为疾病监测、新药开发、药理毒理学研究等开辟新的途径。
1.1体液蛋白质组学研究的“
样品预处
理和制备
样品制备是蛋白质组研究的第一步。样品制备的基本要求是:无盐、苯环化合物、核酸等污染物。样品裂解液由一系列蛋白溶解剂、变性剂和还原剂等混合调制而成,如目前常用的样品裂解液配方为:
8mo·lL-1
尿素+4%3[(3胆酰胺丙基)二乙胺]
丙磺酸(CHAPS)+50~100mmol·L-1
二硫苏糖醇(DTT)+40mmo·lL-1Tris碱。对于体液,若仅仅采用一般样品制备法,由于样品中大量高丰度蛋白的
干扰或溶解不充分,凝胶上显示的PEM会出现许多
水平条纹乃至涂块,掩盖体液中低丰度蛋白的分辨
和鉴定[5
]。而许多的生物信息变化正是体现在这些
低丰度蛋白质或量上的变化。因此,体液样品必须经过特殊预处理才能清楚地显示其蛋白表达情况。1.1.1血清
血清中含有90%~91%的水,6.5%~8.5%的蛋白质和2%左右的低分子量蛋白质。其中白蛋白、α1抗胰蛋白、α2巨球蛋白、转铁蛋白和γ球蛋白等高分子量蛋白占总蛋白的80%以上。由于血清
中白蛋白的含量是40g·L-1,而某些细胞因子的含量每毫升仅为若干pg,其浓度的动态幅度可达1~
109,很难在最大辨别幅度仅10
4的聚丙烯酰胺凝胶上都得以显示[6]。因此,预处理的关键就在于排除
高丰度和高分子量蛋白对低丰度蛋白质的掩盖作用。许多研究者对此进行了有意义的探索。
起初,生物学家尝试通过加大上样量来增加低丰度蛋白的量,但是,低丰度蛋白量上升的同时,白蛋白等亦随之大量载入,最终并不能获得高分辨的低丰度蛋白点。有人提议用离心超滤来滤过白蛋
白,但是Georgiou
等[7
]的工作认为离心超滤(滤过大于30ku的蛋白)不能有效去除白蛋白等,而且导致约16%蛋白质的丢失。
也有一些成功分离白蛋白等并获得低丰度蛋白的报道,但是步骤都比较烦琐,操作也不方便。Her
bert等[8
]采用等电点膜多室电解槽(multicompartment
electrolyzers
)方法进行样品预分级,提高了上样量、分辨率和监测敏感性;与全血浆相比,获得了更丰富
的高酸性蛋白。SabounchiSchǔtt
等[9
]采用“纸桥上样”(paperbridgeloading
)技术把血浆上样量提高到·293
·了10mg,结合窄范围固相pH梯度胶条(narrowrange
immobilizedpHgvaclientstrip
)技术[10
],提高蛋白质点分辨率的同时也减少了水平条纹的产生。
最近Laoudj
等[11
]报道,在重泡胀液中加入一种新的非离子去垢剂TergitolNP7可以促进等电聚焦
稳态的形成,从而缩短了电泳时间,降低了上样量,同时提高了双向电泳聚焦和分辨能力,非常适合用于血清样品的分析。
1.1.2脑脊液
脑脊液存在于蛛网膜下腔,环绕着脑和脊髓,主要由脉络丛、室管膜分泌产生。其成分特点是:高盐
(>150mmo·lL-1
)、低蛋白(与血浆中蛋白量的比值为0.004;白蛋白占总蛋白的50%以上)
、含少量具有重要生物功能的酶。因此,脑脊液样本预处理必须包括去盐、蛋白富集等步骤。
Yuan
等[3
]比较了两种有机配方丙酮及三氯醋酸/丙酮对脑脊液样品进行处理后的效果,发现
三氯醋酸/丙酮除盐较多,但是蛋白质回收量明显降低;此外,还尝试过柱滤过法(Biospin柱,盐和分子量大于6ku
的蛋白质被保留在柱内,蛋白质经洗脱而获得),减少了蛋白质损失量。Davidsson等[
12
]报道用液相等电点聚焦加电洗脱法检测低丰度蛋白
(μ
g·L-1
),检测灵敏度明显提高,所检测到的蛋白中有近1/3
未曾在脑脊液中检出过。1.1.3尿液
尿液是最容易获取的体液,广泛应用于内源及外源性物质的体内代谢、毒理学及许多疾病诊断的研究。尿液中蛋白质的来源主要为肾小球内血液滤过,肾脏自身分泌及泌尿道脱落等,其成分非常复杂。尿液样品中常含有盐成分、管型及其一些微生物,去盐和蛋白富集也是其样品准备不可缺少的步骤。尿液的去盐和蛋白富集步骤一般包括:透析、冻
干、过柱去盐等[13
]。此外,因不同时间和温度条件
下收集到的尿液其成分和蛋白水解程度不同,尿液
收集需要有一个标准操作规范。Marshall
等[13
]报道,收集晨起中段尿至加有蛋白酶抑制剂的无菌试管,经离心、变性后再进行分析,得到了许多感兴趣的多肽成分。
1.2体液蛋白质组学应用情况
与细胞蛋白质组学、微生物蛋白质组学等相比,体液蛋白质组学应用的文献报道很少,主要集中在生物标志物寻找及探索、药物效应及毒理学评价等方面。


