生物信息学复习题百度文库合集
把能够下载的几个文档合在一起,略有删改,希望对于快要考试的各位生物同仁们有帮助
生物信息学,
一、名词解释:
1、生物信息学:生物分子信息的获取、存贮、分析和利用;以数学为基础,应用计算机技术,研究生物学数据的科学。
2、相似性(similarity):两个序列(核酸、蛋白质)间的相关性。
3、同源性(homology):生物进化过程中源于同一祖先的分支之间的关系。
4、同一性(identity):两个序列(核酸、蛋白质)间未发生变异序列的关系。
5、序列比对(alignment):为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性,而将它们按照一定的规律排列。
6、生物数据库检索(database query,数据库查询):对序列、结构以及各种二次数据库中的注释信息进行关键词匹配查找。
7、生物数据库搜索(database search):通过特定序列相似性比对算法,找出核酸或蛋白质序列数据库中与待检序列具有一定程度相似性的序列。
二、简答题:
1、分子生物学的三大核心数据库是什么?它们各有何特点?
GenBank核酸序列数据库;SWISS-PROT蛋白质序列数据库;PDB生物大分子结构数据库;
2、简述生物信息学的发生和发展。
20世纪50年代,生物信息学开始孕育;
20世纪60年代,生物分子信息在概念上将计算生物学和计算机科学联系起来;
20世纪70年代,生物信息学的真正开端;
20世纪70年代到80年代初期,出现了一系列著名的序列比较方法和生物信息分析方; 20世纪80年代以后,出现一批生物信息服务机构和生物信息数据库;
20世纪90年代后,HGP促进生物信息学的迅速发展。
3、生物信息学的主要方法和技术是什么?
数学统计方法;动态规划方法;机器学习与模式识别技术;数据库技术及数据挖掘;人工神经网络技术;专家系统;分子模型化技术;量子力学和分子力学计算;生物分子的计算机模拟;因特网(Internet)技术
4、常见的DNA测序方法有哪些?各有何技术特点和优缺点?
Maxam-Gilbert DNA化学降解法:
优点:可测完全未知序列及CG富含区;
缺点:操作繁琐;
Sanger双脱氧链终止法:
优点:简便,可测较长片段;
缺点:需已知部分序列或加接头;
焦磷酸测序:
优点:廉价、高通量;
缺点:一次测序片段短。
5、分子生物学数据库有哪些类型?各有何特点?
基因组数据库:基因组测序
核酸序列数据库:核酸序列测定
一次数据库:蛋白质序列数据库:蛋白质序列测定。生物大分子(蛋白质)三维结构数据库:X-衍射和核磁共振
特点:数量少,容量大,更新快
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